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List of Questions
1.宏基因組和擴增子技術(shù)的共同點及區(qū)別?
擴增子和宏基因組技術(shù)都是從樣品中的總DNA出發(fā)進行的研究,避免了對微生物進行分離純化和培養(yǎng),提供了對樣品中的暗物質(zhì)進行研究的新技術(shù)。在擴增子技術(shù)中,其主要對微生物DNA上的某一段區(qū)域,如16S V3/ V4/ V3-V4,18S V4,ITS1/ITS2等進行擴增、測序和分析;而在宏基因組技術(shù)中,則會使用樣品中的所有微生物基因組DNA進行研究,并完成后續(xù)一系列數(shù)據(jù)處理和挖掘。相比于基于擴增子測序的研究方法,基于全部DNA測序的宏基因組研究方法可以更全面的分析微生物的物種、基因和功能組成,不僅能夠告訴我們在樣品中“誰在那里”,還能夠告訴我們“它們在干什么”。
2.宏基因組研究的應(yīng)用
宏基因組學(xué)可以全面解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生物之間以及與環(huán)境及宿主之間的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)和研究新的具有特定功能的基因等。由于宏基因組學(xué)的研究對象是特定環(huán)境中的總DNA,不需要對微生物進行分離培養(yǎng)和純化,這對我們發(fā)現(xiàn)難培養(yǎng)或不可培養(yǎng)微生物提供了一條新的途徑。目前,微生物宏基因組學(xué)已經(jīng)成為微生物研究的熱點和前沿,廣泛應(yīng)用于氣候變化、水處理工程系統(tǒng)、極端環(huán)境、人體微環(huán)境(如腸道、口腔、生殖道、皮膚等)與健康、石油污染修復(fù)和生物冶金等領(lǐng)域, 取得了一系列引人矚目的重要成果。
3.宏基因組樣本要求?
樣品類型
樣品質(zhì)量要求
寄送要求
DNA樣品
樣本起始量(單次):≥ 1μg/樣品
短時間(24h內(nèi))保存或運輸可以使用冰袋;長時間(72h內(nèi))運輸建議采用干冰加冰袋的方式。樣本保存期間切忌反復(fù)凍融。
樣本濃度: ≥ 20 ng/uL
樣本純度:OD260/280為1.8-2.0并確保DNA 無降解
其他問題?
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