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List of Questions
1.宏病毒組技術與宏基因組技術和擴增子技術的共同點及區(qū)別?
宏病毒組技術與宏基因組技術和擴增子技術都是從樣品中的總DNA出發(fā)進行研究的,避免了對微生物進行分離純化和培養(yǎng),提供了對樣品中的全部微生物進行研究的新技術。在擴增子技術中,其主要對微生物DNA上的某一段區(qū)域,如16S V3/V4/V3-V4等進行擴增、測序和分析;在宏基因組技術中,則會使用樣品中的所有微生物基因組DNA進行研究,并完成后續(xù)一系列數據處理和挖掘;而在宏病毒組技術中,其主要以環(huán)境中所有病毒的遺傳物質為研究對象,分析樣品中的病毒構成信息。
2.宏病毒組的研究應用
宏病毒組學可以全面解讀樣品中病毒的多樣性和豐度,探索病毒之間以及與環(huán)境及宿主之間的關系。由于宏病毒組學的研究對象是特定環(huán)境中病毒的總DNA+cDNA,因而不需要對微生物進行分離培養(yǎng)和純化,且可以對樣品中的DNA病毒和RNA病毒進行研究,這對我們研究樣品中的總病毒提供了一條新的途徑。
在短短的幾年里,人們用這種方法發(fā)現了很多有意義的病毒,并擴大了很多病毒的宿主范圍,增強了人們對環(huán)境中包括各種媒介生物的病毒組成的了解,研究領域涉及到人類腸道、動物組織、血液、水體等,充分顯示出宏病毒組技術在病毒發(fā)現、病原溯源、微生物預警等方面的應用價值。
3.宏病毒組樣本要求
樣品類型
樣品質量要求
寄送要求
DNA樣品(RNA病毒需要反轉錄為雙鏈DNA)
樣本起始量(單次):≥ 1μg/樣品
短時間(24h內)保存或運輸可以使用冰袋;長時間(72h內)運輸建議采用干冰加冰袋的方式。樣本保存期間切忌反復凍融。
樣本濃度: ≥ 20 ng/uL
樣本純度:OD260/280為1.8-2.0并確保DNA 無降解
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