病毒宏基因組測序又稱宏病毒組(Virome),是在宏基因組學理論上,結(jié)合現(xiàn)有的病毒分子生物學檢測技術(shù)而興起的一個新的學科分支。宏病毒組是一種新興的病毒組學研究技術(shù),它突破了傳統(tǒng)技術(shù)方法的局限。宏病毒組直接以環(huán)境中所有病毒的遺傳物質(zhì)為研究對象,能夠快速準確的鑒定環(huán)境中所有的病毒組成,從而是一種發(fā)現(xiàn)新病毒,監(jiān)控病毒變異的病毒學研究的有力手段。
1. 從測序所得到的原始數(shù)據(jù)出發(fā),首先對原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)控,得到有效數(shù)據(jù)(Clean data);
2. 基于有效數(shù)據(jù)進行物種注釋,同時獲得不同層級的病毒豐度表;
3. 基于不同分類層級的豐度表,進行樣品病毒組成分析;
4. 基于不同分類層級的豐度表,進行多樣性分析和統(tǒng)計分析;
5. 根據(jù)分析需求,可選擇高級分析,深入挖掘樣品中病毒組成和差異,以及單個病毒物種組裝。
分析類別 | 分析內(nèi)容 |
病毒組成分析 | 病毒組成柱狀圖 |
Heatmap圖 | |
Krona圖 | |
多樣性分析 | Alpha多樣性分析 |
PCoA分析 | |
樣品聚類分析 | |
附加分析 | Wilcoxon秩和檢驗分析 |
單個病毒物種組裝 |
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